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프로젝트 디스커버리: Human Protein Atlas
프로젝트 디스커버리(Project Discovery)는 현실 세계의 스위스의 “대규모 멀티플레이어 온라인 사이언스”와 아이슬란드의 “레이캬비크 대학”과 공동으로 진행하는 단백질 아틀라스 프로젝트이다.
복잡한 단백질을 특정한 분류로 나누는 작업은 컴퓨터에게는 매우 어려운 작업이지만, 약간의 학습을 하였다면 비전문가라도 손쉽게 분류할 수 있는 것을 이용한다. 현실 세계에서 분석이 필요한 단백질의 이미지가 주어지며, 플레이어들은 이것을 분석하고 제출하여 과학의 발전에 기여할 수 있게 되는 것.
프로젝트 디스커버리는 KTC 왕립 공학 연구소에서 온 시스터 오브 이브의 Lundberg 교수가 운용하는 연구 프로그램이다. 처음에는 이미 전문가에 의해 분석이 완료된 이미지를 제대로 분석 할 수 있는지 테스트하기 위해 난이도가 낮은 이미지를 분석하게 될 것이며, 정답률이 높아지면 점점 분석이 되지 않은(아직 답이 없는) 문제가 제공된다. 답이 없는 문제는 캡슐리어들이 많이 선택한 선택이 답으로 쳐진다. 이렇게 단백질 분석에 기여하여 ISK와 AK(Analysis Kredit)를 받을 수 있는데, AK는 LP처럼 시스터 LP샵에서 아이템을 구입 할 수 있다.
프로젝트 디스커버리는 네오콤에 있는 메뉴로 언제 어디서든 참여 할 수 있다.
1. 세포 소기관
1.1. 세포핵 (Nucleus)
핵은 파란색으로 표시되어 있다. 큰 둥근 공처럼 보이며 세포의 큰 부분을 차지한다.
가끔은 핵 내의 작은 구조물만 염색됩니다.
1.1.1. 세포핵 - Nucleus
세포핵(Nucleus)은 세포에서 매우 큰 부분을 차지하고 공처럼 생겼다. 하단의 사진에서 푸른색으로 고르게 염색된 것이다.
1.1.2. 핵질 - Nucleoplasm
핵질(Nucleoplasm)은 핵인(nucleoli, 사진에서 작고 길쭉한 원)을 제외한 세포의 모든 것을 감싸고 있다. 핵인(nucleoli)은 사진하단에서 청색 표지자와 겹쳐져있다.
1.1.3. 핵소체(미량) - Nuclear Bodies (few)
핵소체(Nuclear Bodies)는 좌측 사진에서 핵(파란 표지자)내에 5개 이하의 독특한 녹색 점으로 염색되어 있다.
1.1.4. 핵소체(다량) - Nuclear Bodies (many)
핵소체(Nuclear Bodies)는 좌측 사진에서 핵(파란 표지자)내에 6개 이상의 독특한 녹색 점으로 염색되어 있다.
1.1.5. Nuclear Speckles
핵 얼룩(Nuclear Speckles)은 핵(파란 표시)내에 걸쳐서 분포하고 있으며 표범 얼룩무늬처럼 불균일하게 보인다.
1.1.6. Nucleoli
핵인(Nucleoli)은 핵(파란 표시)내의 타원형 처럼 보이는 적은 수의 구조물로 주로 파란 표지자의 구멍과 겹치는 양상을 보이는 것들이다.
1.1.7. Nucleoli (rim)
핵인(Nucleoli) 가장자리는 핵(파란 표시)내의 타원형 처럼 보이는 적은 수의 구조물로 파란 표지자의 구멍과 겹치는 양상을 보이며, 가장자리에 선명하게 염색된 것들이다.
1.1.8. Nucleoli (fibrillar center)
핵인(Nucleoli) 섬유 중심체는 핵(파란 표지자)내의 타원형 처럼 보이는 적은 수의 구조물로 파란 표지자의 구멍과 겹치는 양상을 보이며, 핵소체 내부의 작은 점들의 무리로 나타나는 것들이다.
1.1.9. Nuclear Membrane
핵막(Nuclear Membrane)은 구별이 쉽다. 사진에서 푸른색으로 염색된 핵을 감싸고 있는 얇은 녹색 원이다. 핵막은 종종 여러 겹으로 이루어 진 것 또한 관찰 될 수 있다.
1.2. 세포질 (Cytoplasm)
세포의 핵(파란색)을 제외한 부분. 세포질에는 여러가지 다양한 구조가 있다.
1.2.1. 세포질 - Cytoplasm
세포질은 세포 전체에서 찾아볼 수 있지만 청색으로 표지된 핵에서는 찾아볼 수 없습니다. 그 분포의 강도는 세포에 따라 달라질 수 있으며, 핵 인근으로 갈수록 더 강하게 나타납니다.
1.2.2. 어그레솜 - Aggresome
어그레솜은 청색으로 표지된 핵 바로 옆에서 타원형의 공 형태로 매우 짙게 나타납니다. 적색으로 표지된 미세소관의 구멍과 중첩되어 나타납니다.
1.2.3. 미토콘드리아 - Mitochondria
마치 실과 같은 형태를 하고 있습니다. 혹은 스파게티(때때로 길고, 때로는 짧습니다)와 닮았습니다. 미토콘드리아는 세포 전체에서 찾아볼 수 있습니다. 핵 바로 옆부터 세포의 최외곽부까지 퍼져있습니다.
1.2.4. Rods and ring
작고 선명한 막대와 링 형태의 구조물입니다. 보통 하나 내지는 아주 적은 숫자만 세포에서 나타납니다.
주로 뒤얽힌 로프와 같은 구조로 세포 전체에서 나타납니다. 몇몇 경우에 청색으로 표지된 핵 인근에 작고 짙게 나타나기도 합니다.
1.2.6. 세포골격(미세소관 종단) - Cytoskeleton (microtubule ends)
적색으로 표지된 미세 소관의 중심 혹은 말단에서 나타나는 짧은 실 형태의 구조이며, 미세소관과 완벽하게 겹쳐집니다. 때로 미세소관의 말단부에만 나타나며, 미세소관 전체에 퍼져 있지 않는 경우도 있습니다.
1.2.7. 세포골격(미세소관) - Cytoskeleton (microtubules)
세포 전체에 퍼진 얇은 밧줄입니다. 적색으로 표지된 물체와 완벽하게 겹쳐졌기 때문에 노란색을 나타냅니다.
1.2.8. 세포골격(액틴 필라멘트) - Cytoskeleton (actin_filaments)
길고 직선형의 평행한 필라멘트입니다. 이는 세포의 가장자리를 구분해줍니다.
1.2.9. Cytoskeleton (cytokinetic bridge)
거의 분리되어 떨어진 상태의 세포 사이에서만 관찰할 수 있는 미세구조입니다. 짙게 농축된 미세소관 옆에서 발견됩니다.
1.2.10. 미세소관형성중심 - Microtuble organizing center
1.2.11. 중심체 - Centrosome
적색으로 표지된 미세소관 중심에 겹쳐진 한개 혹은 두개의 점입니다. 청색으로 표지된 핵 바로 옆에 나타납니다.
1.2.12. 세포질그물 - Endoplasmic reticulum
(청색 채널 제외함) 세포 전체에서 찾아볼 수 있는 대칭적인 구조물입니다. 그물과도 같은 구조를 나타내며 마치 거미줄과 같이 생겼습니다.
1.2.13. 골지체 - The Golgi apparatus
골지체는 핵 바로 옆에 위치하고 있습니다. 때로는 주변에 위치하거나, 혹은 위에 위치하기도 합니다. 주로 작고 짙은 입자의 집합체로 보이며 도넛 형태를 띌 가능성이 있습니다.
1.2.14. 소낭 - Vesicles
균일한 크기와 형태를 가진 작고 밝게 빛나는 점입니다. 또한 균일하게 세포 내에 분포하고 있거나, 혹은 청색으로 표지된 핵 바로 옆에 군집을 이루고 있습니다. 하지만 절대 핵 내부에 분포지는 않습니다.
1.3. 주변부 (Periphery)
1.3.1. 세포연접 - Cell junctions
세포가 서로 접촉하고 있을때만 세포의 실질적인 접합부에서 관측할 수 있습니다.
1.3.2. Focal adhesions
1.3.3. 형질막 - Plasma membrane
1.4. 기타
1.4.1. Cell-to-Cell varialtions
1.5. 식별 불가
Negative 또는 Nonspecific staining
1.5.1. Negative
1.5.2. Unspectific